A escola começou a funcionar oficialmente quando uma comissão instaladora foi nomeada por despacho ministerial de Julho de 1984. Esta comissão instaladora geriu a escola de 1984 a 1986. A partir de então, a escola tem sido sempre gerida por órgãos eleitos, à exceção do ano letivo 2010-2011, em que teve uma Comissão Administrativa Provisória, designada pela DRELVT, a fim de agregar a Escola Secundária/3 José Cardoso Pires com o Agrupamento de Escolas General Humberto Delgado. Ao longo da sua existência, a escola tem procurado uma relação integrada com a com unidade, embora a circunstância de esta ser ela própria bastante recente e pouco estruturada, façam com que este seja um dos campos para onde se devem orientar os seus objetivos e ação num futuro próximo.
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